「会社設定」-「採番情報」の「採番区分」で「見積番号」を選択することで、設定することができます。

こちらを設定することで、見積入力の新規ボタンを押した時に出てくる「会社コード体系」の画面に反映されます。
今回は、大型物件を選択し、OKを押すと、見積番号が「00000001-00」で採番されました。