各設定での動作の違いは以下をご確認ください。
＜完全一致の同期＞
転送先会社のデータを一度削除してから取り込みます。
「転送コード」で範囲指定している場合は、範囲内の工事だけ洗い替えされます。

＜追加モードによる同期＞
転送先会社に登録されていないデータのみを追加します。
転送先の会社データに既に同じコードがある場合は追加も上書きもされません。

＜上書きモードによる同期＞
転送先会社に登録されていないデータは追加し、同じコードで登録されているデータがある場合は上書きします。

また、「接続会社と同期」の機能については、こちらをご確認ください。