インボイスを発行する場合は、「会社設定」の「基本情報」で、「消費税の調整対象」を「外税と内税」と設定します。そうすると、内税入力においても、発注者の消費税計算に基づいて、税抜金額・消費税額をそれぞれ自動計算します。