「Excelフリー設定」-「項目定義」が「拡張モード」になっていない可能性があります。
項目定義によっては「拡張モード」でなければ出力できないものもありますので変更を試してみてください。

なお、「標準モード」でも出力できる項目は「項目定義」一覧のシートに「〇」が付いているものになります。