どちらでも問題ありません。
ただし、6階層で見積明細を作成した場合は、「予算入力」で「見積参照」を行うと、予算は4階層までの管理になりますので、5、6階層で入力した明細は4階層目にまとめられます。
お困りのことは何ですか？
見積
「初期設定」-「見積情報」の「入力階層」は6階層と4階層のどちらに設定すればよいでしょうか？
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