「目標利益」は「請負金額-予算金額」です。そこから「一般管理費」を引いた金額が「目標純利益」となります。

一般管理費は、予算入力時に、該当工事に関わる一般管理費用として見込金額を入力することができます。

「初期設定」-「工事情報」の「管理費計算」で、「工事登録で入力（請負額×率）」を選択した場合は、「工事登録」-「請負情報」で登録した「請負金額」に、「工事登録」-「基本情報2」で設定した「一般管理費率」をかけて、一般管理費を計算します。
「初期設定」-「工事情報」の「管理費計算」で、「実行予算で入力」を選択した場合は、「見積/予算」-「予算入力」で、「工事費用区分：一般管理費」の費目の金額が一般管理費として集計されます。