仕入明細の汎用データ受入はすべて追加での受入となり、上書き更新はできません。
仕入明細の他にも支払明細や売上明細など伝票明細の受入では上書き更新ができません。

登録済みのデータを修正したい場合は、登録済みのデータを一度削除してから汎用データ受入にて修正したデータを取り込んでください。
仕入明細の汎用データ受入の手順はこちらをご覧ください。