「仕訳データ転送」の画面に明細が表示されている場合は、会計ソフト側に転送されます。
転送済みにチェックがついている明細を転送したくない場合は、「条件設定」で「転送方式」を「未転送」にして、転送されていない明細分のみを表示した状態で転送します。
お困りのことは何ですか?
会計連動
仕訳データ転送で、転送済みにチェックが入っていないのだが、転送済みにチェックがついている明細はもう転送されませんか?

「仕訳データ転送」の画面に明細が表示されている場合は、会計ソフト側に転送されます。
転送済みにチェックがついている明細を転送したくない場合は、「条件設定」で「転送方式」を「未転送」にして、転送されていない明細分のみを表示した状態で転送します。